Kaišiadorių vyskupija įsteigta 1926 m., įsteigus Lietuvos bažnytinę provinciją.

Kaišiadorių vyskupijai nuo 2012 m. vadovauja vyskupas Jonas Ivanauskas.

Apaštalų Sostui 1991 m. Lietuvoje įsteigus Kauno ir Vilniaus metropolijas, Kaišiadorių vyskupija priskirta Vilniaus metropolijai.

Gyventojų Kaišiadorių vyskupijoje apie 90 tūkstančių. Vyskupija užima 6557 km2 plotą ir yra suskirstyta į Alytaus, Birštono, Elektrėnų, Kaišiadorių, Merkinės, Molėtų ir Širvintų dekanatus.

Šešiasdešimt aštuoniose vyskupijos parapijose darbuojasi daugiau nei 40 kunigų. Žymiausias vyskupijos dvasinės traukos centras yra Švč. M. Marijos užtarimu garsėjanti Pivašiūnų šventovė bei palaimintojo Teofiliaus koplyčia Kaišiadorių katedroje, kur ilsisi palaimintojo palaikai – relikvija. Katedra ir vyskupijos kurija bei jos vadovaujami centrai – Katechetikos, Šeimos, Jaunimo, Caritas – yra Kaišiadoryse, antrajame pagal dydį vyskupijos mieste.

Vyskupijoje įsikūrusios trys moterų vienuolijos, taip pat darbuojasi vienuolės iš vienuolijų, įsikūrusių kitose Lietuvos vyskupijose. 

Jaunuoliai ir vyrai, besirengiantys tapti kunigais Kaišiadorių vyskupijoje, studijuoja Kauno ir Vilniaus kunigų seminarijose; 2025 m. diakono šventimai suteikti 1 asmeniui, kunigystei ruošiasi 2 asmenys.

2024-2025 mokslo metais vyskupijos mokyklose dirbo daugiau nei 40 tikybos mokytojų ir katechetų. Iš apie 10 tūkstančių Kaišiadorių vyskupijos teritorijoje besimokančių mokinių katalikų tikybą buvo pasirinkę didesnė pusė.

Vyskupijoje, kai kuriose parapijose – Pivašiūnuose, Širvintose, Želvoje – veikia parapijų kuruojami globos namai, Paparčiuose – Šv. Juozapo vaikų globos namai; Birštone veikia sakralinis muziejus ir vyskupijos svečių namai – administruoja Domus hotel, kuriuose galima apsistoti poilsiui, rengti mokymus. Guronyse veikia rekolekcijų namai – administruoja Eucharistinio Jėzaus seserų kongregacija.

Nuo 1991 m. Kaišiadorių vyskupija palaiko partnerystės ryšius su Magdeburgo vyskupija Vokietijoje; per šį laikotarpį buvo įgyvendintas ne vienas projektas sielovados srityje. Magdeburgo vyskupijos pastoracijos seminarijoje yra sėmęsi patirties parapijų veikloje nemaža jaunuolių iš Kaišiadorių vyskupijos, ir kitaip padėta vyskupijai, atsikuriančiai po sovietmečio.